根据法律规定，离婚时关于子女的抚养权归属一般会考虑双方的具体情况和孩子的意愿。在您的情况下，由于您和对方已经达成协议，且孩子已经三岁，通常情况下，法院会在尊重双方意见的基础上作出判决。 如果您的孩子希望与母亲一起生活，而父亲不同意，那么法院可能会倾向于维持这种状态。但是，在做出决定前，还需要考虑其他因素，如双方的经济条件、教育背景、家庭关系等。 最终的判决结果需要由法院依据相关法律规定进行裁决，并考虑到孩子的最佳利益。如果您对法院的判决有异议，可以在规定时间内提出上诉。 在此过程中，您可以寻求专业的法律帮助，以确保自己的权益得到保护。同时，也要注意保持冷静，避免情绪化地处理事情。