《中华人民共和国民法典》第二百零九条规定。“不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。”因此，如果房屋所有权人已经将房屋过户至其女儿名下，并且双方签订了书面协议明确表示该房屋的所有权归其女儿所有，则该协议在法律上是有效的。 然而，需要注意的是，《民法典》也规定了某些特殊情况下的物权变动需要经过特定程序或进行公证。例如，对于继承或者赠与等涉及财产转移的情形，法律规定应当办理相关手续并进行公证才能生效。此外，在处理此类事务时，应确保所有的文件都是合法合规的，以避免因法律瑕疵而导致的纠纷。 综上所述，虽然根据现有法律规定，该协议可能在某些情况下被认定为有效，但在实际操作中，建议在任何涉及到产权转移的事项前，都应寻求专业的法律意见，以便最大程度地保护自己的权益。同时，如果有可能的话，考虑通过正规的公证程序来确认产权归属，以减少后续可能出现的风险。