我父有2套宅基地，一套是1983年前审批娶妻生子的，另一套是奶奶遗留的老宅（爷爷入赘，有1959年的产权证）。1997年村统一登记宅基地使用权，2套房子的土地证都做成了我父名字。2套房子分别于2002、2004年重建，因政策原因都是未批先建。爷爷2003年去世，父亲有我和妹妹两个女儿，都30几岁，未婚。现父亲去办理宅基地不动产权证，土地局说我父“一户两宅”，一套都不予确权。请问，这样合理吗？怎么办