如果您的公司因工程亏损而欠下债务，并且劳动局支付了相应的工程款，这种情况可能不会构成严重的法律问题。不过，具体情况需要根据您所在的国家或地区以及具体情况进行分析。 通常情况下，工程款的支付是基于合同条款和法律规定进行的。如果您的公司在工程中存在违约行为，如未按期完成施工或者施工质量不符合要求等，可能会导致项目延期或者终止，进而影响到工程款的支付。在这种情况下，您应该与劳动局协商解决办法，以确保自己的权益得到保障。 此外，如果您认为劳动局的行为违反了相关法律法规，可以考虑向相关部门投诉或提起诉讼来维护自身合法权益。但请注意，具体的解决方案应依据当地的法律法规和实际情况制定，建议寻求专业的法律帮助。