根据《中华人民共和国土地管理法》的规定，农村村民住宅用地由县级人民政府批准。因此，如果政府将农民的住房认定为“棚户区”，并将其作为城市规划的一部分进行改造或拆除，这可能涉及到违法占地和违法建设的问题。此外，对于涉及公共利益的拆迁补偿等问题，应当遵循公平、公正的原则，并且需要依法进行评估和补偿。 在具体操作过程中，政府应严格遵守法律法规，确保程序透明、公正，同时也要充分听取公众意见。对于任何违反法律规定的行为，公民有权向有关部门举报，以维护自己的合法权益和社会公共利益。