首先，两人现在有结婚证，就说明两人已经是合法夫妻。 怀孕三个月，假如女方这个孩子生下来，男方就必须负有抚养义务，不管他是否愿意。而关于男方不同意流产，根据《中华人民共和国妇女权益保障法》，女方有按照国家有关规定生育子女的权利，也有不生育的自由。 女方的合法权益受到侵害的，可以向妇女组织投诉，妇女组织应当维护被侵害妇女的合法权益，且有权要求并协助有关部门或者单位查处。