美容院进行的扁平疣治疗活动通常被视为合法。根据中国法律规定，如果美容院在提供服务时遵循了相关法律法规和标准，并且没有违反相关的医疗管理规定，则其行为不会构成违法行为。 然而，需要注意的是，在任何情况下，都应确保服务提供者具备相应的专业知识和技能。因此，建议您咨询专业的医疗机构或专业人士以获取更准确的信息。同时，提醒您在选择提供此类服务的机构时，要仔细审查其资质和信誉，避免因不正规的服务而产生不必要的风险。