您好！根据法律规定，签订房地产开发合同时，应当由具有相应资质的单位或个人作为乙方，并且乙方应具备相应的主体资格，如拥有足够的资金实力、经验等。在您的情况下，如果村长作为甲方与建筑公司（乙方）签订了合作协议，但建筑公司的法律代表人为村长的侄女，则可能存在一定的法律风险。 首先，从合法性角度来看，村长作为甲方与建筑公司签约的行为可能涉嫌违反相关法律法规。根据《中华人民共和国土地管理法》等相关规定，农村集体土地不得以任何形式转让给私人企业或其他组织进行房地产开发。 其次，建筑公司作为乙方是否具备相应资质也是一个关键问题。如果建筑公司在签订合同时不具备必要的资质或者存在其他瑕疵，也可能导致该协议无效或被撤销。 因此，建议您详细审查双方签订的合同条款，确保所有条款均符合当地法律法规的规定。同时，考虑到涉及土地使用权的问题，建议寻求专业的法律顾问帮助，以确保您的权益得到保护。