您好！根据我国相关法律规定，对于子女的抚养权归属，通常会优先考虑有利于子女成长的原则。在您所描述的情况下，如果孩子的先天性疾病是由男方因素引起的，且该疾病对孩子的健康和生活造成了重大影响，那么法院可能会倾向于判决由女方（即您的配偶）作为主要抚养人。此外，由于您目前处于哺乳期，可能需要额外照顾孩子的需求，因此在抚养费支付方面，建议双方可以协商确定一个公平合理的金额，并尽可能地考虑到孩子的实际需求。同时，如果您确实面临经济困难，可以通过申请社会救助或者通过其他途径获得必要的经济支持。总之，在处理此类案件时，应当充分考虑孩子的最佳利益以及双方的具体情况，以确保公正合理的结果。