首先，分居三年在法律上可以作为离婚的理由之一。即使男方不同意离婚，你仍然可以通过法律途径提出离婚诉讼。关于证件问题，你可以尝试联系当地公安机关户籍管理部门，说明情况，请求补办身份证或其他相关证件。如果男方不配合提供户口本，你可以向公安机关说明情况，请求协助。 至于诉讼费用，离婚案件的诉讼费通常不高，而且如果你经济困难，可以向法院申请减免诉讼费或者申请法律援助。此外，离婚案件中，法院会根据双方的经济状况和抚养能力，判决子女的抚养权和抚养费问题。 你可以先尝试与男方协商解决，如果协商无果，可以聘请律师或自行向法院提起离婚诉讼。在诉讼过程中，法院会根据你们双方的实际情况，对财产分割、子女抚养等问题作出公正的判决。记得收集好所有可能需要的证据，如分居证明、经济状况证明等，以便在法庭上使用。