在您的情况下，您提到的员工和公司的行为可能涉及了一些复杂的法律问题。首先，关于员工是否应该一直保留发票而不让公司作废的问题，这主要取决于双方之间的合同条款以及当地的法律规定。 根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十条的规定。“单位和个人发生经营业务收取款项时，应向付款方开具发票；收款方不得要求购买方提供其他证明文件。”因此，如果员工已经提供了有效的发票并完成了相应的交易记录，那么公司就应当接受该发票作为付款的凭据，并且不得随意将发票作废或拒绝支付。 然而，如果员工没有按照合同约定提供有效的发票，或者发票内容与实际交易不符，那么公司有权拒绝接收发票并要求其补足差额。在这种情况下，公司可能会采取一些措施来保护自己的权益，例如通过诉讼或其他法律途径来解决纠纷。 此外，如果您认为公司的行为违反了相关法律法规或者存在欺诈等行为，您可以考虑寻求专业的法律顾问的帮助，以维护自己的合法权益。 总之，在处理此类争议时，重要的是要确保所有的操作都符合相关的法律和规定，并尽可能地避免任何潜在的风险。希望以上信息对您有所帮助。