您好！如果您的借款已经偿还，并且您与借款人之间就房屋使用权的协议仍然有效，那么您可以向法院申请确认该协议的有效性。在法院的判决中，您将有权获得房屋的所有权或使用权。然而，这需要您证明该协议是有效的，而且双方都同意按照协议执行。 如果您认为该协议无效，您可以考虑通过法律途径解决。例如，您可以寻求律师的帮助来分析协议的合法性和有效性。此外，您还可以尝试协商解决问题，或者向法院提出诉讼请求。 请记住，在处理此类问题时，请务必仔细审查所有相关的文件和证据，以确保您的权益得到保护。