根据我国《中华人民共和国义务教育法》的相关规定，学校应当保障适龄儿童、少年接受义务教育的权利。如果学生旷课被学校认定为违反了学校的管理制度，那么学校有权采取必要的措施进行教育和管理，但必须符合法律规定，并且不得对学生造成人身伤害或损害其合法权益。 然而，在这种情况下，如果该学生确实存在学习上的困难或其他特殊情况导致无法正常参加课堂学习，学校可以考虑调整教学计划或者提供其他帮助来支持其完成学业。同时，学校也有义务确保学生的安全和健康，包括但不限于给予适当的休息时间、安排适合的学习活动等。 在任何情况下，学校的行为都应遵守法律法规和社会伦理道德，尊重学生的权利并履行相应的责任。如果学校滥用权力或侵犯了学生的合法利益，学生可以寻求法律援助，通过司法途径维护自己的权益。