你好，根据《中华人民共和国民法典》的规定，当你与船舶管理公司签订劳动协议后，你有权要求该公司的合法行为。如果你认为你的劳动协议已经解除，并且该公司扣留了你的押金和船员证书，你可以采取以下步骤来保护你的合法权益。 首先，你应该立即联系该公司并要求退还你的押金和船员证书。 如果他们拒绝返还这些物品，你应该考虑向当地的劳动监察部门或法院提起诉讼。 在诉讼过程中，你可以寻求专业的法律帮助，以确保你的权利得到充分保护。 请记住，在处理此类争议时，保持冷静和理性和证据收集至关重要。希望这些建议能对你有所帮助。