在处理此类交通事故时，需要遵循相关法律法规和公平合理的原则。根据您提供的信息，可以初步判断以下几点。 医疗费。如果摩托车驾驶员因事故受伤并住院治疗，保险公司通常会负责支付必要的医疗费用。这不包括误工费等其他非直接医疗费用。 赔偿费用。对于摩托车驾驶员及其家属而言，除了医疗费用外，可能还包括误工损失（如工作收入减少）、陪侍费用（如家庭成员照顾费用）等间接损失。这些费用应由肇事方承担，并且不应从保险理赔金中扣除。 修车费用。由于修车费用是事故造成的直接后果，应当从保险赔付中扣除。但需要注意的是，在实际操作过程中，可能会存在一定的纠纷或争议，具体如何处理还需参考当地的法律规定和司法实践。 责任划分。虽然摩托车驾驶员负主要责任，但考虑到双方都有过错，保险公司一般会依据各自的过错程度来确定赔偿比例。具体的赔偿金额需要根据交警部门出具的责任认定书来计算。 综上所述，关于赔偿的具体数额以及是否能从保险理赔中扣除修车费用等问题，建议及时联系专业的法律顾问进行详细咨询和指导。同时，确保所有沟通和证据材料均符合当地法律法规的要求，以维护自己的合法权益。