您好！根据《道路交通安全法》的规定，车辆在使用过程中发生故障或损坏时，应当及时向公安机关交通管理部门报告，并按照规定办理相关手续。如果您认为自己的摩托车存在合法的行驶证和保险凭证，且更换了符合规定的发动机，那么您可以直接前往交警队进行处理，但需要提供相关的证明材料，如事故责任认定书等。 另外，如果您的摩托车是因交通事故而造成的损坏，您还可以通过保险公司申请赔偿。请注意，具体的处理流程可能会因为不同的情况有所不同，请您咨询当地的交警部门或保险公司以获取更准确的信息。