食品卫生许可证是在当地卫生局办理的。具体流程是：1.申请人填写相应的申请表，到当地受理窗口递交某某市食品卫生许可证申请书；2.提交办理食品卫生许可证的材料；3.食品卫生许可证办理人员审批，在收到申请后五个工作日内做出是否受理决定，受理后二十个工作日内做出审批决定；4.作出准予决定后十个工作日发放食品卫生许可证。