首先，根据我国相关法律规定，农村村民在本集体经济组织内的房屋、宅基地等财产属于集体所有。因此，如果您的父亲被村里的管理处接收并转为非农户籍，那么他的户口和相应的财产也应当归入村集体所有。 其次，关于您提到的菜园协议，虽然没有明确表明该菜园是否已经收取租金，但是从通常情况看，租赁合同应该有明确的租金支付条款。如果没有签订正式的租赁合同或者合同中未明确约定租金支付事宜，则一般情况下应视为无偿使用。因此，在这种情况下，村集体也没有权利要求您父亲支付任何费用。 再次，对于您父亲所承包的土地，尽管他已不再享有实际耕种的权利，但仍应被视为村集体财产的一部分。如果村集体认为其拥有对这部分土地的所有权，并且有权进行征收，那么您父亲可能确实不符合获得土地补偿的条件。 最后，如果您父亲因为不是户籍人口而无法享受国家规定的土地补偿政策，建议寻求当地政府部门的帮助，了解具体的政策规定以及可能的救济途径。同时，也可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，比如申请行政复议或提起诉讼。