您好，根据您提供的信息，您在2015年向他人借款9万元，并于2016年6月偿还了其中的5万元。在2016年9月，您与对方就剩余的5万元达成还款协议，并约定了还款期限。因此，您需要按照约定的时间和金额偿还剩余的款项。如果您的资金状况发生变化，建议及时联系对方协商解决方案，以避免债务纠纷。同时，您可以考虑通过法律途径解决这一问题，以维护自己的合法权益。