如果您的骨折是在医院治疗过程中未能得到妥善处理，并且在几个月后在外地的三甲医院进行了复查并发现了骨折的后遗症。如果您希望进行司法鉴定来确定责任方或赔偿金额，首先应由您本人提出申请。 在通常情况下，由于您已经与医院或其他医疗机构存在合同关系（例如医保协议），您有权要求他们承担相应的责任和赔偿义务。因此，在这种情况下，您可以直接向该医疗机构提起诉讼或者协商赔偿事宜。如果您对医院的处理结果不满意，也可以通过法律途径寻求帮助。 至于是否可以拒绝进行司法鉴定，这取决于具体的情况和法律规定。一般而言，除非有明确的法律规定禁止或限制某些行为，否则被告方（即您）有权拒绝进行司法鉴定。然而，具体的法律条款可能会有所不同，建议您详细查阅相关法律法规以获取准确信息。