分居五年后想要离婚，即使结婚证丢失，也不影响您办理离婚手续。在中国，离婚可以通过协议离婚或诉讼离婚两种方式进行。 1. **协议离婚**：如果您和配偶能够就离婚事宜达成一致，包括财产分割、子女抚养等问题，可以直接到一方户籍所在地的婚姻登记机关办理离婚登记。在这种情况下，结婚证的丢失不是问题，因为婚姻登记机关可以通过户籍信息确认婚姻关系。 2. **诉讼离婚**：如果双方无法达成协议，您可以向人民法院提起离婚诉讼。在诉讼过程中，法院会根据您提供的证据和情况来判断是否准予离婚。结婚证丢失的情况下，您可以提供其他证明婚姻关系的证据，如户口本、子女的出生证明等。 在办理离婚手续前，建议您先尝试联系婚姻登记机关或咨询专业律师，了解具体的办理流程和所需材料。如果结婚证确实无法找回，婚姻登记机关或法院会根据其他证据来确认您们的婚姻关系。