尊敬的用户， 您提到的土地被他人占用，并且已经进行了99年的第二轮土地承包。在进行土地确权的过程中，村里的决定可能会涉及到对这块地的具体处理方式。 根据我国法律规定，村民委员会作为基层群众性自治组织，在进行土地确权时应当遵守相关法律法规和政策规定，确保土地确权过程中的公平公正。 对于您提到的老爷子留下的遗嘱，如果该遗嘱符合当地的相关规定，那么按照遗嘱的内容来分配土地是合理的。但是需要注意的是，农村土地确权工作是由县级人民政府国土资源管理部门负责实施的，因此您需要向当地的自然资源部门咨询具体的处理流程和相关政策，以保证您的合法权益得到保障。 如果您还有其他关于土地确权、土地纠纷等方面的问题，欢迎您继续提问。我将尽力为您提供帮助和支持。