您好，根据您提供的信息，关于您的案件，存在一些复杂的法律问题需要详细考虑和分析。首先，您提到的“派出所”出具的协议书是否有效，以及该协议中涉及的房屋面积是否包括您的部分，都需要进一步调查确认。其次，您与邻居之间的纠纷是否已经通过派出所调解，并且达成了一致意见。如果之前已达成一致，且协议已被双方认可，那么该协议可能具有一定的法律效力。但是，如果在协议签订后，对方又提出新的要求或主张权利，此时应该重新评估协议的有效性，并寻求其他途径解决纠纷。 另外，您提及到您父母作为见证人在协议上签字的行为是否有效，这取决于协议的内容是否符合法律规定。如果您认为协议中的某些条款侵犯了您的合法权益，您可以向法院提起诉讼，请求撤销该协议。 最后，您提到的协议未经户主签字的问题，这是一个非常敏感和复杂的问题。在大多数情况下，除非有明确的法律规定允许第三方代替当事人签署文件，否则未经当事人同意的代签行为是非法的。因此，在这种情况下，建议您尽快聘请专业的律师进行详细的法律咨询和指导，以确保自己的权益得到保护。