您的侄女在申请日本研修时所签署的合同可能存在一些不合理的条款。首先，根据法律规定，从事任何工作都需要有相应的劳动保护和工资保障，包括支付不低于最低工资标准的报酬。如果合同中规定的薪酬低于最低工资标准，那么该合同可能被视为无效或部分无效。 其次，关于合同中的“每小时八百日元”这一约定，虽然日本法律允许企业设定较低的日薪标准（通常为每小时800日元左右），但需要符合一定的条件，并且需要经过适当程序获得批准。因此，如果该企业未按照规定程序获取审批就擅自提高员工的日薪标准，这可能会构成违法行为。 建议您尽快与公司的法律顾问沟通，了解具体的情况并寻求专业的法律意见。同时，也可以考虑向当地的人力资源和社会保障部门投诉，以维护自己的合法权益。此外，如果您认为合同存在其他不合理之处，也应积极收集证据，以便在未来解决问题时能够提供有力的支持。