在民事诉讼中，如果被告对原告的债权人资格提出有事实依据的抗辩，这通常意味着被告认为自己与原告之间的债务关系并不成立。这种情况下，法院可能会审查双方之间的合同条款、历史交易记录等信息，以确定是否存在真实的债权债务关系。 根据《中华人民共和国民法典》第89条的规定，一方当事人因对方违约而遭受损失的，有权要求对方承担损害赔偿责任。因此，在没有证据证明双方之间存在真实的债权债务关系的情况下，被告提出的抗辩是有事实依据的。 然而，需要注意的是，即使存在抗辩理由，最终是否能获得胜诉还需要考虑多种因素，如案件的具体情况、法律规定以及法官的裁量权等。因此，建议您和您的法律顾问详细讨论此案，并寻求专业的法律意见。