在处理离婚案件时，通常情况下是以法院的判决为准。如果您有两份不同的离婚协议书，并且其中一份是通过民政局存档的，那么这将作为您的证据之一。但是，在最终确定离婚协议的有效性时，应该考虑以下几点。 两个协议是否一致？是否有任何差异或矛盾之处？ 您和对方是否同意使用这份协议？ 协议中关于财产分配、孩子抚养权等关键条款是否符合法律规定？ 如果您认为民政局存档的那份协议更可靠或者您对另一份协议存在疑虑，建议与律师进行详细讨论，以便更好地了解该情况并做出明智决定。 请注意，上述信息仅供参考，具体操作应基于当地法律法规及实际情况。