根据法律规定，父母协议离婚时所达成的关于财产分割的协议，在未经人民法院判决确认之前，具有一定的约束力。因此，如果协议中明确指定了房产归属给儿子，并且已经办理了相关手续，那么法院一般会尊重该协议。 然而，继女作为子女之一，有权主张其应得的份额。在这种情况下，继女可以通过向法院提起诉讼的方式，请求对已有的协议进行调整或重新分割。同时，她还可以考虑与继父协商解决这个问题，以争取更多的权益。 最终，如何处理这一争议需要综合考虑各方的具体情况和法律依据。建议双方在律师的帮助下，详细研究并了解相关的法律法规，以及现有协议的内容，以便做出最有利的决策。