你好！关于你所提到的问题，首先需要明确的是，赔偿协议书中的公章是否有效，这取决于该公章在合同法和相关法律法规中是否有明确规定。一般来说，如果盖章人是项目部的负责人或授权代表，并且其行为符合法律规定，则该公章可以被视为有效的。然而，具体适用的情况还需要结合具体情况来判断。 此外，即使公章有效，也并不意味着直接与公司发生劳动关系。根据劳动合同法的规定，只有当双方签订书面劳动合同后，劳动者才能与用人单位建立正式的劳动关系。因此，在这种情况下，你需要确保协议书中已经包含了双方的权利义务以及劳动条件等内容，并且该协议必须经过合法程序签订，以保证其有效性。 最后，如果你对赔偿协议的具体条款有疑问，建议寻求专业的法律顾问进行详细的解答和指导。他们可以根据具体的案例情况提供更为准确的法律意见。