根据法律规定，如果一方有义务支付子女的抚养费，即使离婚协议中约定子女由另一方抚养，也需要按照法律规定支付。因此，在这种情况下，孩子的医疗费用确实应该由男方承担。如果您需要进一步的帮助或解答，请提供更具体的情况和细节，以便更好地为您提供帮助。