根据我国相关法律法规的规定，如果房屋的所有权人对被征用的土地享有所有权，并且该土地上有一部分房屋为合法建筑，另一部分则为违法建筑，则在土地被征用时，所有者有权获得相应补偿。 然而，在实际操作中，由于不同地区和国家的法律规定可能存在差异，因此建议您咨询当地的政府部门或律师，以了解具体的情况和可能的解决方案。他们将能够提供更准确的信息和指导。