如果在离婚时房屋登记在一方名下，且另一方主张房屋属于共同财产，则双方可能需要协商处理。如果一方坚持认为该房屋属于其个人财产，并要求将其作为离婚协议的一部分，那么另一方可能需要考虑是否同意。 在这种情况下，建议双方寻求专业的房地产律师进行咨询和指导，以确保双方的权益得到保护。律师可以帮助评估离婚协议中关于房屋归属的条款，以及如何解决争议。此外，律师还可以帮助确定在离婚后如何处置房屋，比如是否需要重新申请住房补贴或公积金贷款等。最终，根据具体情况，可能还需要向法院提起诉讼来确认房产的具体归属情况。