根据《土地管理法》的规定，农村集体经济组织或者村民委员会应当将集体所有的土地用于农业建设，并按照国家规定采取措施保护和改善生态环境。如果村集体在征用土地过程中，确实存在扣除一定比例补偿金的情况，那么这个扣除的比例需要符合法律法规的规定。 如果您对村集体的处理方式有疑问或不满，建议您首先与村委会进行沟通协商，了解具体的扣除原因和计算方法。如果双方无法达成一致，可以考虑通过政府相关部门进行调解或者申请行政复议，以维护自己的合法权益。 同时，在处理此类问题时，应注意保留相关的证据材料，如合同、协议等，以便于日后维权时提供支持。