您好！根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，当事人可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。如果您认为您的权利受到侵害，且被告在昆山工作但户籍不在昆山，您可以选择在昆山法院提起诉讼。但是，请注意，具体案件处理需要结合具体情况和相关法律规定进行分析，并请考虑聘请专业的法律顾问以确保您的权益得到充分保护。