在人民法院主持的协议离婚中，通常情况下一方或双方会将房屋等财产过户至另一方名下。在这种情况下，如果双方达成一致并签订书面协议，并且该协议符合法律规定和程序要求，则可以按照协议约定进行财产转移。 然而，在这种情况下，关于“房款”是否应该交给法官或者如何分配，应当根据具体情况进行考虑。例如，如果协议中明确指定了具体的款项数额用于购买房产，那么这部分金额应归于共同所有的一方；如果协议没有明确规定，那么需要根据双方的具体协商结果来决定。 此外，还需要注意的是，尽管可以通过协议离婚的方式解决财产分割的问题，但这并不意味着离婚后就可以完全免除对配偶的责任。对于未尽到家庭义务、虐待、遗弃等情况下的责任追究，仍然需要遵循相关法律法规的规定执行。 因此，在处理此类案件时，建议咨询专业的法律人士以获得更准确的指导。