您好！根据我国相关法律法规，工厂要求员工在工作期间禁止吸烟是合理的。如果工厂采取了罚款措施来鼓励员工遵守这一规定，并且这些罚款不强制性地作为工资的一部分，而是作为一种额外的惩罚或奖励，那么这种做法通常被认为是合法的。 然而，在某些情况下，如违反规定的频率高或者严重影响工作环境时，工厂可能需要采取更严厉的措施，例如解除劳动合同等。在这种情况下，员工应该与工厂进行沟通并寻求解决方案。 总之，是否需要员工签署罚款单以及罚款金额是否计入工资应由工厂和员工双方协商决定，并确保所有行为符合当地法律法规。希望这些建议对您有所帮助。