您好，在土地清点丈量的过程中，如果已有的确权结果得到了认可，并且补偿已经到位，那么在后续的土地使用中，通常不需要再进行新的清点和丈量。这主要是为了保证土地权益的稳定性和公平性。 如果您认为自己在项目一期占地时已进行了土地清点并获得了相应的补偿，但是在二期占地中发现了一些未被使用的土地，您可以向相关机构或管理部门提出质疑并要求重新清点和丈量。同时，您也可以向相关的政府部门报告这一情况，以便相关部门能够及时介入处理。 对于村主要干部是否有责任的问题，这需要根据具体的法律法规来判断。一般来说，村主要干部可能需要对村庄的公共利益负责，包括保护耕地资源、合理利用土地等。但如果是在未经合法程序的情况下擅自占用土地，可能会影响到土地的合法权益，这时村主要干部可能会被视为责任人之一。 总之，如果您遇到这样的情况，建议首先按照当地的法律规定和程序来解决问题，如果无法解决，也可以考虑通过法律途径寻求帮助。