您好！根据我国《土地管理法》等相关法律法规的规定，房屋建造需要经过合法程序，并且应当依法取得相应的审批手续。如果在未经批准的情况下擅自建设房屋，则可能构成违法建筑，无法获得任何补偿或赔偿。 因此，您所提到的“协议”中关于赔偿的具体金额（3000元）是不合理的。建议您与对方协商解决，或者向当地有权机关申请处理，以维护您的合法权益不受侵害。同时，请确保所有行为都符合相关法律规定，避免因违法行为而受到不必要的处罚。