房屋及诊所设施设备转让是否合法需要根据具体情况来判断。一般来说，如果双方在合同中明确约定转让条件，并且没有违反法律法规的规定，则该转让行为是合法的。 然而，在某些情况下，例如存在未披露的重要信息或欺诈行为时，即使在合同中也可能会导致转让协议的无效。因此，建议您详细审查转让协议的内容和条款，确保其符合法律规定和您的权益保护。 此外，如果您对转让协议的有效性有疑问，可以寻求专业的法律意见，以确保您的合法权益得到充分保障。