根据《中华人民共和国森林法》的规定，国家鼓励植树造林、保护林木。但是，在沟渠中种植树木并不属于国家绿化项目的范畴。因此，如果在沟渠中种植树木可能会影响农耕地的质量，那么这可能是违反了相关法律规定的行为。 具体来说，按照《中华人民共和国森林法》第十五条的规定，“任何单位和个人都有保护森林资源的义务，并有权对破坏森林资源的行为进行检举和控告。”此外，《中华人民共和国土地管理法》也规定，“禁止在永久基本农田上挖塘养鱼”。 综上所述，虽然沟渠中种植树木可能有助于改善生态环境，但如果这种行为不符合上述法律法规的要求，则可能存在违法性。建议您咨询专业的法律顾问或相关部门，以获得更准确的法律意见。