您好！根据您描述的情况，如果您的农用拖拉机在更换发动机时没有按照规定进行登记或提交相关文件，则可能存在违法行为。这种行为违反了《中华人民共和国道路交通安全法》等相关法规。 在某些情况下，即使您未按规定进行登记，但如果更换的发动机符合法定标准且不影响车辆性能和安全性，并且您已经进行了必要的维修和保养工作，可能不会构成重大违法行为。然而，具体是否构成违法行为还需要根据当地交通管理部门的具体规定来判断。 如果您已被交警部门发现并受到处罚，建议及时联系当地的交通管理部门了解具体的处罚情况，并按照要求进行处理。同时，为了避免未来的法律风险，以后在使用农用拖拉机时，请务必确保遵守相关规定，包括但不限于定期进行年检和维护等。希望这些建议对您有所帮助。