您好！如果您持有的是90年代的土地使用证书，且在该土地上建设了房屋，并且已经合法使用多年，那么您可能需要关注一下当前的政策变化。根据相关法律规定，如果该土地存在争议，相关部门有权暂停或者终止对该土地的使用权，但这种情况下并不意味着您的土地使用权将被取消或收回。 如果您认为自己的权益受到了侵害，建议您及时与当地政府有关部门进行沟通和协商，了解具体的处理流程和期限。同时，也可以考虑聘请专业的律师帮助您分析具体情况并提出解决方案。希望这些建议能够对您有所帮助。