一、关于回迁住房被镇政府拆迁办擅自非法扣押并直接处理的问题 首先，您应该了解当地法律法规对拆迁补偿和房屋权益保护的规定。如果您认为拆迁行为侵犯了您的合法权益，您可以向当地房地产管理机构（如城市规划局）投诉或申请行政复议。同时，也可以考虑通过法律途径解决。 二、关于抵押房产证借款未经登记的法律效力问题 根据我国法律规定，对于未经登记的抵押权，其法律效力可能有限。因此，在办理相关业务时，建议您先确认所涉抵押权是否已经依法进行了登记。如果尚未进行登记，应当尽快到相关部门办理登记手续，以确保权利的有效性。 三、关于找哪个部门起诉的问题 一般来说，可以找当地的人民法院提起诉讼。在具体操作过程中，您可以向法院提交相关的证据材料，并按照法律规定进行诉讼程序。 以上是针对您的问题的一般性解答，具体情况还需要结合实际情况来分析。如有需要进一步的帮助，请及时联系专业的律师进行咨询和指导。