在上诉法院处理的离婚案件中，如果双方同意调解并达成协议，则应按照调解程序进行。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院在审理离婚案件时，应当先行调解；调解不成的，方可作出判决。 对于当事人是否可以拒绝调解的问题，一般来说，调解是解决婚姻纠纷的一种有效方式，有利于维护家庭和谐和社会稳定。但如果一方当事人明确表示不同意调解或调解无效，另一方有权申请强制执行以保护自己的权益。因此，在这种情况下，虽然一方当事人可以拒绝调解，但另一方仍有权采取其他法律手段来解决问题。 至于拒绝调解对利害关系的影响，通常来说，这不会导致任何不利后果。但在某些特殊情况下，如涉及子女抚养权和财产分割等重大利益的争议，可能需要通过更严格的调解程序或者法律途径解决。总之，具体情况需要根据具体案件的实际情况来分析和判断。