您好，根据您提供的信息，如果双方已经就医疗费用达成协议并已经支付了部分款项，那么可能不会影响到被告人的判决结果。在刑事审判中，法院通常会考虑被告人是否具有悔罪表现、是否有能力赔偿等情形来决定是否适用缓刑。 然而，具体能否适用缓刑还要看案件的具体情况和法律规定。如果您需要进一步的法律帮助，请联系专业的法律顾问进行详细咨询。