首先，根据《中华人民共和国公司法》的规定，有限责任公司的注册资本必须由全体股东实缴，并且应当在公司章程中明确记载。 其次，在您所描述的情况下，您的两个小股东有权要求退出公司，因为大股东未按照公司章程的要求及时办理退股手续，导致公司无法进行正常的经营管理活动。 再次，关于赔偿的问题，如果大股东不愿意退出公司，您可以考虑通过法律途径解决。根据我国的法律规定，当有限责任公司存在违法行为时，其股东可以通过提起诉讼的方式，要求解散公司并分配剩余财产。 最后，如果您对公司的经营状况有疑问，建议聘请专业的会计师事务所进行审计，以便了解公司的财务状况，从而做出合理的决策。同时，也可以与大股东沟通，协商解决问题的方法，避免对公司未来的经营造成不良影响。