在合伙经营中，如果涉及到发票开具的问题，确实可能会涉及一些法律风险。在这种情况下，建议您首先了解相关的法律规定和合同条款。 根据中国增值税的相关规定，一般情况下，如果企业或个人购买货物和服务时，没有取得相应的发票，则需要按照实际支付的金额进行税务申报和缴纳增值税。因此，如果商家未向厂家索取并使用了包含税率的发票，可能涉嫌违反税收法规。 至于是否可以起诉对方，具体情况需要根据双方签订的合同以及当地的具体法律法规来确定。通常情况下，如果商家有证据证明其并未收到包含税率的发票，并且能够提供真实有效的收据或者账单作为支持，那么可以通过法律途径维权。 请注意，具体的法律适用可能会因地区而异，因此建议您在处理此类案件之前寻求专业的法律顾问的意见。