基本农田上面种树是违法的。国家建立了基本农田保护制度，通过《土地管理法》《基本农田保护条例》等法律法规予以确认。《土地管理法》第36条规定：禁止占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼《基本农田保护条例》第17条规定：禁止任何单位和个人在基本农田保护区内建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。禁止任何单位和个人占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼。《土地管理法》、《基本农田保护条例》等法律法规均规定了严禁在基本农田里种树，但均未对基本农田里种了树该怎样处理作出规定。虽然在基本农田内种树会对国家粮食安全造成影响，但从我国农业历史来看，这一行为在农村长久普遍存在，有历史传统和现实需要。实践中，种树一般不会破坏耕作层，而且耕地种树是将土地现状从耕地变为林地，两者均属于农用地，不算改变用途。因此法律未对这一行为设定行政处罚