《中华人民共和国民法典》规定了夫妻双方因感情不和分居两年以上的，可以视为自动离婚。但是，《民法典》对这一条款进行了修改，现在的规定是。男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。法院在审理过程中，应当查明双方是否确已分居两年以上，并据此作出判决。 因此，在处理此类案件时，需要根据具体情况判断是否符合法定情形，并按照法律规定的方式提起诉讼。具体而言，如果夫妻双方确实因感情不和而分居两年以上，并且符合其他法律规定的情形（如分居期间有子女抚养权纠纷等），那么法院可能会认定为自动离婚。但需要注意的是，这仅是一种可能的情况，实际情况还需根据具体的案情来确定。