我是八月出的交通事故，病假至12月结束，交了社保，当天就和公司联系报工伤，两个月后去社保局查询并未申报，后联系公司，安排人员重新申报，但第三个月工资就不发了，原因说是我个人申报工伤，费用由肇事方理赔，想问公司是否应该给予我后两个月或者一个月的基本工资，现在病假结束，公司让填写离职单，请问是否影响工伤流程，谢谢