根据法律规定，一方父母对未成年子女有抚养教育的权利和义务。在婚姻关系存续期间，如果夫妻双方同意并签订书面协议，明确约定男方原有的房产份额作为孩子的抚养费，并且该协议没有违反法律强制性规定或损害他人利益，则该协议应当有效。同时，由于男方的财产已被法院查封三年，这可能会影响其支付抚养费用的能力。 然而，具体的处理方式还需要考虑多个因素，包括但不限于双方的具体情况、财产状况以及孩子的需求等。因此，在决定如何处理这一情况时，建议咨询专业的法律顾问以获取更详细的信息和建议。